Protein–RNA interactions for Protein: Q07105

Gdf9, Growth/differentiation factor 9, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf9Q07105 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Gdf9Q07105 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Gdf9Q07105 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms