Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Epha4Q03137 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Epha4Q03137 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Epha4Q03137 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms