Protein–RNA interactions for Protein: P97468

Cmklr1, Chemokine-like receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmklr1P97468 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cmklr1P97468 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cmklr1P97468 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms