Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Bop1P97452 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bop1P97452 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bop1P97452 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Bop1P97452 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms