Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Taf1bP97358 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Taf1bP97358 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Taf1bP97358 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms