Protein–RNA interactions for Protein: P63139

Nfyb, Nuclear transcription factor Y subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfybP63139 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
NfybP63139 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NfybP63139 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NfybP63139 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfybP63139 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfybP63139 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NfybP63139 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NfybP63139 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NfybP63139 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NfybP63139 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NfybP63139 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 229.8 ms