Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RTP1P59025 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RTP1P59025 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RTP1P59025 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP1P59025 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP1P59025 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP1P59025 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP1P59025 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP1P59025 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RTP1P59025 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RTP1P59025 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RTP1P59025 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RTP1P59025 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP1P59025 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP1P59025 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP1P59025 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP1P59025 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP1P59025 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP1P59025 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RTP1P59025 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP1P59025 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP1P59025 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP1P59025 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP1P59025 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP1P59025 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP1P59025 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RTP1P59025 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RTP1P59025 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP1P59025 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP1P59025 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP1P59025 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP1P59025 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RTP1P59025 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RTP1P59025 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms