Protein–RNA interactions for Protein: P52734

Fgd1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd1P52734 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Fgd1P52734 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Fgd1P52734 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Fgd1P52734 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms