Protein–RNA interactions for Protein: P49682

CXCR3, C-X-C chemokine receptor type 3, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR3P49682 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CXCR3P49682 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CXCR3P49682 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms