Protein–RNA interactions for Protein: P40630

Tfam, Transcription factor A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TfamP40630 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TfamP40630 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TfamP40630 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TfamP40630 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TfamP40630 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TfamP40630 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TfamP40630 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TfamP40630 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TfamP40630 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TfamP40630 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TfamP40630 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TfamP40630 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TfamP40630 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TfamP40630 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TfamP40630 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TfamP40630 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TfamP40630 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TfamP40630 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TfamP40630 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TfamP40630 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TfamP40630 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
TfamP40630 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TfamP40630 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TfamP40630 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TfamP40630 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TfamP40630 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TfamP40630 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TfamP40630 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TfamP40630 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TfamP40630 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TfamP40630 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TfamP40630 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TfamP40630 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TfamP40630 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TfamP40630 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms