Protein–RNA interactions for Protein: P32958

Rom1, Rod outer segment membrane protein 1, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rom1P32958 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rom1P32958 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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