Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tacr1P30548 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tacr1P30548 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms