Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ERCC5P28715 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ERCC5P28715 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ERCC5P28715 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms