Protein–RNA interactions for Protein: P18525

Ig heavy chain V region 5-84, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18525 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
P18525 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
P18525 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P18525 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P18525 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P18525 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
P18525 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P18525 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
P18525 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P18525 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P18525 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P18525 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.2 ms