Protein–RNA interactions for Protein: P11088

Flg, Filaggrin (Fragment), mousemouse

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FlgP11088 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FlgP11088 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FlgP11088 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FlgP11088 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FlgP11088 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FlgP11088 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FlgP11088 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FlgP11088 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FlgP11088 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FlgP11088 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FlgP11088 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FlgP11088 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FlgP11088 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FlgP11088 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FlgP11088 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FlgP11088 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FlgP11088 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FlgP11088 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
FlgP11088 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FlgP11088 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FlgP11088 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FlgP11088 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FlgP11088 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FlgP11088 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FlgP11088 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FlgP11088 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FlgP11088 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FlgP11088 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FlgP11088 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FlgP11088 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FlgP11088 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FlgP11088 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FlgP11088 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FlgP11088 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FlgP11088 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FlgP11088 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FlgP11088 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms