Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
IGHV1-8P0DP01 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms