Protein–RNA interactions for Protein: O75400

PRPF40A, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 957 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40AO75400 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PRPF40AO75400 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PRPF40AO75400 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
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