Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tpd52l1O54818 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tpd52l1O54818 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms