Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Hdac1O09106 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Hdac1O09106 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Hdac1O09106 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms