Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
LIPT2A6NK58 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIPT2A6NK58 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms