Protein–RNA interactions for Protein: A6NIU2

LINC01549, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01549, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01549A6NIU2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LINC01549A6NIU2 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LINC01549A6NIU2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms