Protein–RNA interactions for Protein: A3KG59

Pm20d2, Peptidase M20 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pm20d2A3KG59 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pm20d2A3KG59 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pm20d2A3KG59 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms