Protein–RNA interactions for Protein: A2AKM2

Hacd4, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 4, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd4A2AKM2 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Hacd4A2AKM2 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Hacd4A2AKM2 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.4 ms