Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rbm6S4R1W5 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rbm6S4R1W5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rbm6S4R1W5 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms