Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ubl3Q9Z2M6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms