Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E4

PCDHB5, Protocadherin beta-5, humanhuman

Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB5Q9Y5E4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PCDHB5Q9Y5E4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PCDHB5Q9Y5E4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms