Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
FBXW11Q9UKB1 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FBXW11Q9UKB1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXW11Q9UKB1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms