Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RABGEF1Q9UJ41 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RABGEF1Q9UJ41 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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