Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 CT009738.1-201ENSMUST00000219031 809 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Lhx6Q9R1R0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Lhx6Q9R1R0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms