Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gpc1Q9QZF2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gpc1Q9QZF2 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms