Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CHCHD3Q9NX63 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CHCHD3Q9NX63 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220 ms