Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TREX1Q9NSU2 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TREX1Q9NSU2 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms