Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC40A1Q9NP59 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SLC40A1Q9NP59 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms