Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bco1Q9JJS6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
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Bco1Q9JJS6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Bco1Q9JJS6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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Bco1Q9JJS6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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Bco1Q9JJS6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Bco1Q9JJS6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Bco1Q9JJS6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
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