Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccl28Q9JIL2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccl28Q9JIL2 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms