Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Krt34Q9D646 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Krt34Q9D646 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Krt34Q9D646 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms