Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Rnf17Q99MV7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Rnf17Q99MV7 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Rnf17Q99MV7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms