Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INPP4AQ96PE3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
INPP4AQ96PE3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INPP4AQ96PE3 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INPP4AQ96PE3 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INPP4AQ96PE3 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INPP4AQ96PE3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
INPP4AQ96PE3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
INPP4AQ96PE3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
INPP4AQ96PE3 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms