Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
STAMBPL1Q96FJ0 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAMBPL1Q96FJ0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
STAMBPL1Q96FJ0 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.3 ms