Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC37.2■■■■□ 3.55
TOPBP1Q92547 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.17■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC37.17■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC37.16■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC37.16■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
TOPBP1Q92547 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
TOPBP1Q92547 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.1■■■■□ 3.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms