Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXE1

ATRIP, ATR-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRIPQ8WXE1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATRIPQ8WXE1 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ATRIPQ8WXE1 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms