Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Q9

Shtn1, Shootin-1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shtn1Q8K2Q9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Shtn1Q8K2Q9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Shtn1Q8K2Q9 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Shtn1Q8K2Q9 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms