Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYE1

CCDC13, Coiled-coil domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13Q8IYE1 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CCDC13Q8IYE1 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC13Q8IYE1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC13Q8IYE1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms