Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Atg4dQ8BGV9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Atg4dQ8BGV9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Atg4dQ8BGV9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms