Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Zbtb40Q6PCS8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Zbtb40Q6PCS8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Zbtb40Q6PCS8 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
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