Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Wdr44Q6NVE8 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Wdr44Q6NVE8 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms