Protein–RNA interactions for Protein: Q66X01

Nlrp9c, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 9C, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp9cQ66X01 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Nlrp9cQ66X01 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Nlrp9cQ66X01 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms