Protein–RNA interactions for Protein: Q66JQ7

Knl1, Kinetochore scaffold 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knl1Q66JQ7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Knl1Q66JQ7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
Knl1Q66JQ7 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Knl1Q66JQ7 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms