Protein–RNA interactions for Protein: Q64291

Krt12, Keratin, type I cytoskeletal 12, mousemouse

Predictions only

Length 487 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt12Q64291 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Krt12Q64291 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Krt12Q64291 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Krt12Q64291 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms