Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Mre11Q61216 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Mre11Q61216 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Mre11Q61216 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 488 ms